宝塔面板中的MySQL数据库在运行一段时间后自动停止，通常是由于以下几个原因造成的。以下是详细的排查和解决方法。

原因 解决方法
磁盘空间不足 1. 检查数据库所在磁盘空间。2. 清理不必要的文件，释放空间。
临时文件夹空间不足 1. 检查TMP或TEMP文件夹所在磁盘空间。2. 清理临时文件，释放空间。
数据库负载过大 1. 优化数据库配置文件。2. 优化SQL查询，减少负载。
数据表读写错误 1. 使用phpMyAdmin修复和优化表。2. 检查并修复损坏的数据表。